Вакцины мРНК изменяют таки геном человека
Jun. 14th, 2021 06:00 pmSARS-CoV-2 RNA reverse-transcribed and integrated into the human genome
- PMID: 33330870
- PMCID: PMC7743078
- DOI: 10.1101/2020.12.12.422516
Abstract
Prolonged SARS-CoV-2 RNA shedding and recurrence of PCR-positive tests have been widely reported in patients after recovery, yet these patients most commonly are non-infectious. Here we investigated the possibility that SARS-CoV-2 RNAs can be reverse-transcribed and integrated into the human genome and that transcription of the integrated sequences might account for PCR-positive tests. In support of this hypothesis, we found chimeric transcripts consisting of viral fused to cellular sequences in published data sets of SARS-CoV-2 infected cultured cells and primary cells of patients, consistent with the transcription of viral sequences integrated into the genome. To experimentally corroborate the possibility of viral retro-integration, we describe evidence that SARS-CoV-2 RNAs can be reverse transcribed in human cells by reverse transcriptase (RT) from LINE-1 elements or by HIV-1 RT, and that these DNA sequences can be integrated into the cell genome and subsequently be transcribed. Human endogenous LINE-1 expression was induced upon SARS-CoV-2 infection or by cytokine exposure in cultured cells, suggesting a molecular mechanism for SARS-CoV-2 retro-integration in patients. This novel feature of SARS-CoV-2 infection may explain why patients can continue to produce viral RNA after recovery and suggests a new aspect of RNA virus replication.
Перевод:
РНК SARS-CoV-2 подверглась обратной транскрипции и интегрировалась в геном человека
Лигуо Чжан, Алексия Ричардс, Эндрю Халил, Эмиль Вограм, Хайтинг Ма, Ричард А Янг, Рудольф Йениш
PMID: 33330870 PMCID: PMC7743078 DOI: 10.1101/2020.12.12.422516
Бесплатная статья PMC
Аннотация
Продолжительное выделение РНК SARS-CoV-2 и рецидивы ПЦР-положительных тестов были широко представлены у пациентов после выздоровления, однако эти пациенты чаще всего неинфекционные. Здесь мы изучили возможность того, что РНК SARS-CoV-2 могут подвергаться обратной транскрипции и интегрироваться в геном человека, и что транскрипция интегрированных последовательностей может объяснять ПЦР-положительные тесты. В подтверждение этой гипотезы мы обнаружили химерные транскрипты, состоящие из вирусных последовательностей, слитых с клеточными, в опубликованных наборах данных об инфицированных SARS-CoV-2 культивируемых клетках и первичных клетках пациентов, что соответствует транскрипции вирусных последовательностей, интегрированных в геном. Чтобы экспериментально подтвердить возможность вирусной ретроинтеграции, мы описали доказательства того, что РНК SARS-CoV-2 могут транскрибироваться в клетках человека обратной транскриптазой (ОТ) с элементов LINE-1 или ОТ ВИЧ-1, и что эти последовательности ДНК могут интегрироваться в геном клетки и впоследствии транскрибироваться. Экспрессия эндогенного LINE-1 у человека индуцировалась при заражении SARS-CoV-2 или под воздействием цитокинов в культивируемых клетках, что позволяет предположить молекулярный механизм ретроинтеграции SARS-CoV-2 у пациентов. Эта новая особенность инфекции SARS-CoV-2 может объяснить, почему пациенты могут продолжать продуцировать вирусную РНК после выздоровления, и предполагает новый аспект репликации РНК-вирусов.